三个月宝宝咳嗽可以考虑生活方式调整、中药调理、肺部理疗、支气管扩张剂、抗生素治疗等方法进行治疗。如果咳嗽伴有其他症状或持续时间较长，应尽快就医以确定适当的治疗方案。

1.生活方式调整

通过改善睡眠姿势、减少室内烟雾等方式来缓解症状。此方法适合于轻度呼吸系统疾病引起的夜间咳嗽。

2.中药调理

根据患儿体质特点配制汤药，如麻杏石甘汤等以清热化痰止咳。适用于小儿因风寒入里化热所致之表里同病证候。但需注意观察服药后反应及变化情况。

3.肺部理疗

利用声波、振动等物理因子作用于人体，如超声波疗法、微波疗法等。可促进局部血液循环，缓解呼吸道不适。实施前应确保设备安全有效，并按说明书操作。

4.支气管扩张剂

通过吸入或口服给药形式发挥作用，如沙丁胺醇、异丙托溴铵等。主要用于舒张痉挛状态下的支气管平滑肌，减轻咳嗽症状。使用时须遵循医嘱，监测副作用。

5.抗生素治疗

主要针对由细菌感染引起的情况，如阿莫西林、头孢克肟等。对于有明确细菌感染指征的患者效果较好。在使用过程中要完成整个疗程以防耐药性产生。